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Format de données
Modèle FHIR de la prescription

Modèle FHIR de la prescription

Introduction

La modélisation du résultat du scan d’ordonnance repose sur l’utilisation des ressources FHIR Bundle, RequestGroup, MedicationRequest, DocumentReference, Patient et Practitioner.

Rappel de la documentation FHIR

Un seul objet RequestGroup est généré. Il contient directement les autres ressources nécessaires et ne dépend pas d’un système externe, il est ainsi complètement autonome.

Différents jeux de valeurs et terminologies sont utilisées et documentés. En l’absence de mention explicite, les jeux de valeurs suggérés par HL7 sont utilisés.

💡

Attention !

Le contenu exact de la ressource FHIR de la prescription évoluera en fonction des avancées sur la reconnaissance de posologie. Vous serez prévenu en avance en cas de changement cassants (lesquels ne sont pas prévus pour le moment).

Description des objets

Objet RequestGroup

Cet objet représente l’ordonnance en tant que telle

Exemple de RequestGroup

{
  "resourceType": "RequestGroup",
  // unique identifier for the whole prescription
  "identifier": [
    {
      "system": "id://posos",
      "value": "aca3fb04-dc8c-4091-b7f9-c907eea05d1d"
    }
  ],
  // Raw prescription as read by our scanner and converted in very basic html
  "text": {
    "status": "generated",
    "div": "<div xmlns=\"http://www.w3.org/1999/xhtml\"><ul><li>CELLCEPT 500<br/>1 comprimé matin et soir pendant 15 jours</li><li>CORDANCYL 20<br/>60 mg par jour le matin au petit-déjeuner pendant 3 semaines puis 50 mg par jour le matin pendant 3 semaines puis 40 mg par jour le matin pendant 3 semaines puis 30 mg par jour le matin pendant 3 semaines</li></ul></div>"
  },
  "contained": [
    // List of all embedded Medications, MedicationRequest(s), Patient and Practitioner resources
  ],
  // if it can be read, the date of authoring
  "authoredOn": "2022-04-01T12:32:00.000Z",
  "status": "draft", // POSOS will always push prescriptions as draft
  "intent": "order",
  // This represent the Patient entity to link the prescription to
  "subject": {
    "reference": "urn:uuid:68ff0a08-89f5-408b-9d78-1106cba4c44d"
  },
  // Beware we're sending here who is scanning the prescription, not its original author
  "author": {
    "reference": "urn:uuid:a3e2ce74-ff1f-443f-86b0-f9c53417749b"
  },
  // Each action is a reference to a MedicationRequest
  "action": [
    {
      "resource": {
        "reference": "#511e1fa4-2aed-4cd9-a64e-2c652a266ddc"
      }
    },
    {
      "resource": {
        "reference": "#5e9eadf9-7730-47f9-bbe2-a87216db252c"
      }
    }
  ]
}

Objet inclus - MedicationRequest

Une ligne de prescription, concerne souvent un seul médicament et des instructions de dosage.

Exemple de MedicationRequest

{
  "resourceType": "MedicationRequest",
  // Unique identifier for the prescription line
  "id": "511e1fa4-2aed-4cd9-a64e-2c652a266ddc",
  "text": {
    "status": "generated",
    // Raw text as read by our scanner
    "div": "<div xmlns=\"http://www.w3.org/1999/xhtml\">Cellcept 500mg<br/>1 comprimé matin et soir pendant 15 jours</div>"
  },
  "status": "draft", // same as in RequestGroup
  "intent": "order", // same as in RequestGroup
  // should be same as in RequestGroup
  "subject": {
    "reference": "urn:uuid:68ff0a08-89f5-408b-9d78-1106cba4c44d"
  },
  // The prescribed medication, a reference to the Medication resource defined in `contained` field
  "medicationReference": {
    "reference": "#93bd1aa2-7a85-47e1-b332-e3caccdf5cb9"
  },
  // Dosage conforms to FHIR Dosage resource
  "dosageInstruction": [
    {
      // There is always at least a text representation.
      // For complex dosages where no model could be infered, only text will be present
      "text": "1 comprimé matin et soir pendant 15 jours",
 
      // "1 comprimé matin et soir pendant 15 jours"
      // "for 15 days, take 2 times per 1 day during breakfast and dinner"
      "timing": {
        "repeat": {
          "boundsDuration": {
            "system": "http://hl7.org/fhir/ValueSet/duration-units",
            "unit": "day",
            "value": 15
          }, // for 15 days
          "frequency": 2, // take 2 times
          "period": 1, // per 1
          "periodUnit": "d", // day
          "when": ["CM", "CV"] // during breakfast and dinner
          // when values are from http://hl7.org/fhir/valueset-event-timing.html
        }
      },
 
      // it doesn't apply for this drug but we may also provides with
      // an administration route
      // "route": {
      //   "text": "intramusculaire",
      //	 "coding": [
      //		 {
      //		 	 "system": "http://snomed.info/sct",
      //		   "code": "78421000",
      //			 "display": "Intramuscular use"
      //		 }
      //	 ]
      // },
 
      // for each take, take 1 tablet
      "doseAndRate": [
        {
          "doseQuantity": {
            "value": 1,
            "unit": "comprimé",
            "system": "http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v3-orderableDrugForm",
            "code": "TAB"
          }
        }
      ]
    }
  ],
  // A reliability class for the structuration of the posology (high,medium or low),
  // For more details on this score see https://www.posos.care/docs/apis/guides/integration-scan#score-de-confiance
  "extension": [
    {
      "url": "https://terminology.posos.co/fhir-extension/medicationrequest/structurationReliability",
      "valueCoding": {
        "system": "https://terminology.posos.co/dosageStructurationScore",
        "code": "high"
      }
    }
  ]
}

Objet inclus - Medication

Un médicament en lien avec une MedicationRequest.

Exemple de Medication

{
  "resourceType": "Medication",
  "id": "da084efc-01ad-4614-a92a-2573120664b7",
  // Different coding of this drug in different terminologies
  // There should always be at least a DCI or ATC code
  "code": {
    "coding": [
      {
        "system": "http://posos.on.fhir/shortname",
        "code": "cortancyl",
        "display": "cortancyl"
      },
      {
        "system": "http://posos.on.fhir/dci",
        "code": "prednisone",
        "display": "Prednisone"
      },
      {
        "system": "http://www.whocc.no/atc",
        "code": "H02AB",
        "display": "GLUCOCORTICOIDES"
      }
    ]
  },
  // Active ingredient of the medication
  // Substance is coded with DCI
  "ingredient": [
    {
      "itemCodeableConcept": {
        "coding": {
          "system": "http://posos.on.fhir/dci",
          "code": "prednisone",
          "display": "Prednisone"
        }
      },
      // Strength is a bit cumbersome for tablets
      // It must be read as "20mg per 1 tablet"
      "strength": {
        "numerator": {
          "value": 20,
          "system": "http://unitsofmeasure.org",
          "code": "mg"
        },
        "denominator": {
          "value": 1,
          "system": "http://terminology.hl7.org/CodeSystem/v3-orderableDrugForm",
          "code": "TAB"
        }
      }
    }
  ]
}

Objet Patient

Le patient concerné par la prescription : il doit être défini pour attacher la prescription au bon dossier patient dans le système de destination.

Exemple de Patient

{
  "resourceType": "Patient",
  "id": "urn:uuid:68ff0a08-89f5-408b-9d78-1106cba4c44d",
  // Patient are just identified by an identifier coming from destination system
  "identifier": [
    {
      "system": "id://partner",
      "value": "38fd36cc-2148-4ee5-852a-4f0533d0c375"
    }
  ]
}

Objet Practitioner

Le practicien qui a scanné la prescription.

Exemple de Practitioner

{
  "resourceType": "Practitioner",
  "id": "urn:uuid:a3e2ce74-ff1f-443f-86b0-f9c53417749b",
  // Practitioner are identified in both destination system and POSOS
  "identifier": [
    {
      "system": "id://partner",
      "value": "9e3f7b92-6ca3-4466-b970-abae9b56b4fa"
    },
    {
      "system": "id://posos",
      "value": "3e71ff9a-221b-497b-983a-f546cf8b9ea4"
    }
  ]
}

Objet Observation

Les éventuelles observations patient détectées par le scan. Inclut le poids, la taille, l'IMC et l'âge.

Exemple de Observation

{
  "resourceType": "Observation",
  "id": "647d6030-5600-4a31-b1d7-bc854b95a53f",
  "status": "preliminary",
  "category": [
    {
      "coding": [
        {
          "system": "http://terminology.hl7.org/CodeSystem/observation-category",
          "code": "vital-signs",
          "display": "Vital Signs"
        }
      ],
      "text": "Vital Signs"
    }
  ],
  "code": {
    "coding": [
      {
        "system": "http://loinc.org",
        "code": "21612-7",
        "display": "Age - Reported"
      }
    ],
    "text": "Age"
  },
  "subject": {
    "reference": "urn:uuid:f7d09973-4677-4fb5-822d-35f63566f4ea"
  },
  "valueQuantity": {
    "value": 46,
    "unit": "a",
    "system": "http://unitsofmeasure.org",
    "code": "a"
  }
}

Objet DocumentReference

Les informations relatives pour retrouver le document de l'ordonnance scannée au format PDF sont précisées dans un objet DocumentReference, lui même référencé par le RequestGroup dans une extension. L'objet DocumentReference est placé au niveau du Bundle, comme une entry à part entière et a le format suivant:

Exemple de DocumentReference

{
  "resourceType": "DocumentReference",
  "id": "f7d09973-4677-4fb5-822d-35f63566f4ea",
  "identifier": [
    {
      "use": "usual",
      "system": "https://terminology.posos.co/storage-path",
      "value": "https://urlinterneposos/423132123.pdf"
    }
  ],
  "status": "current",
  "content": [
    {
      "attachment": {
        "url": "https://urlpubliquetemporaire/9123891.pdf",
        "data": "efc2b..."
      }
    }
  ]
}
  • Le champ identifier[0].value contient une URL interne POSOS pour le document et qui n'est pas accessible pour consultation
  • Le champ status contient soit la valeur "current" si le document a été correctement sauvegardé, soit "entered-in-error" si une erreur a eu lieu lors de sa génération. En cas d'erreur, l'objet content[0].attachment sera vide
  • Le champ content contient systématiquement un seul objet et content[0].attachment.url contient l'URL publique pour récupérer le PDF dynamiquement (valable pendant 24h après le scan). L champ "data" peut contenir le document PDF en base64 selon la configuration

En complément, ce DocumentReference est référencé par une extension dans le RequestGroup :

Exemple de RequestGroup contenant l'extension

{
  ...,
  "extension": [
    ...,
    {
      "url": "https://terminology.posos.co/fhir-extension/requestgroup/prescriptionDocumentReference",
      "valueReference": { "reference": "urn:uuid:f7d09973-4677-4fb5-822d-35f63566f4ea" }
    }
  ]
}

Format v1 (dépréciée)

Ce format de réponse est déprécié et ne doit plus être utilisé. Il est conservé afin d'assurer la rétro-compatibilité. Il peut être activé en passant le paramètre shouldSimplify=true à l'API de scan d'ordonnance.

Interface

type ScanOrdoApiResponse = {
  patientObservations?: {
    age?: number;
    weight?: number;
    height?: number;
  };
  drugs: {
    entity: string;
    dci: string[];
    boundingPolyVertices?: [
      { x: number; y: number },
      { x: number; y: number },
      { x: number; y: number },
      { x: number; y: number }
    ];
    strength?: string;
    isStrengthInMedicalDB?: boolean;
    posology?: string;
    structuredPosology?: PosologyInstruction[];
    form?: string;
  }[];
};

Exemple

{
  "patientObservations": {
    "age": 45,
    "weight": 73,
    "height": 175
  },
  "drugs": [
    {
      "entity": "inexium",
      "dci": ["ésoméprazole"],
      "boundingPolyVertices": [
        { "x": 133, "y": 173 },
        { "x": 251, "y": 172 },
        { "x": 251, "y": 194 },
        { "x": 133, "y": 195 }
      ],
      "strength": "20 mg",
      "isStrengthInMedicalDB": true,
      "posology": "Prendre 1 comprimé le soir, pendant 1 mois.",
      "structuredPosology": [
        {
          "frequency": 1,
          "period": 1,
          "period_unit": "day",
          "bounds_duration": {
            "value": 1,
            "unit": "month"
          },
          "when": ["EVE"],
          "frequency_texts": ["le soir"],
          "duration_text": "pendant 1 mois"
        }
      ]
    }
  ]
}

L’objet contient un champ patientObservations contenant :

AttributDescription
agel’âge du patient en années si il existe
weightle poids du patient en kg si il existe
heightla taille du patient en cm si elle existe

Un champ drugs contenant la liste des médicaments reconnus. Chaque médicament est à minima décrit par 2 concepts :

AttributDescription
dciun champ tableau contenant une unique chaine de caractère correspondant libellé de la dénomination commune du médicament reconnu
entityle shortname du médicament s’il est reconnu, sinon sa dci.

Les champs suivants ne sont pas toujours présents:

AttributDescription
boundingPolyVerticesles coordonnées du texte qui a servi à reconnaître le médicament. Si l’image envoyée est un PDF, ces coordonnées seront normalisée (entre 0 et 1). Sinon, elles seront en pixels.
strengthla quantité de substance active (couramment appelée dosage); si aucune n’a pu être reconnue, la valeur est à null.
isStrengthInMedicalDBflag valant true si la strength est reconnue ET a été identifiée et validée dans notre base d’information sur les médicaments, false sinon.
formla forme prescrite si reconnue ET dans notre base d’information sur les médicaments. Absent sinon.
posologyla posologie sous forme textuelle non structurée telle qu’écrite dans l’ordonnance. Absent si aucune indication de posologie n’a pu être détectée.
structuredPosologyla posologie sous forme structurée (une liste de PosologyInstruction), c’est un tableau de différentes informations extraites de la valeur de posology. Les concepts et syntaxe utilisés se rapprochent des ressources Dosage et Timing de FHIR

PosologyInstruction

AttributDescription
frequencyfréquence de prise du médicament (si frequency_max existe, frequency correspond à la fréquence minimale)
frequency_maxfréquence maximale
periodcorrespond à la période pendant laquelle frequency prises ont lieu
period_unitunité de la période
period_maxcorrespond à la période maximale
bounds_durationdurée du traitement
time_of_daytableau de string, heures de la journée où le traitement doit être pris (8h, 12h30, ...)
day_of_weektableau de string, jours de la semaine où le traitement doit être pris (mon, tue, wed, thur, fri, sat, sun)
whentableau de string, moments de la journée auxquels ont lieu le traitement (les significations des codes sont expliquées dans ce site https://www.hl7.org/fhir/valueset-event-timing.html#definition (opens in a new tab)
offsetintervalle de temps entre la prise et when, en minutes
sequencechiffre commençant à 0 indiquant la succession des posologies (2 cpr pendant une semaine puis 1 cpr pendant 1 mois)
frequency_textstableau de string, liste des différents textes correspondant aux fréquences
bounds_duration_textstring, texte correspondant à la durée du traitement
quantity_and_rateQuantityAndRate, information sur la quantité de médicament par prise/par unité de temps

BoundsDuration

AttributDescription
unitunité de la durée du traitement
valuedurée (minimale) du traitement
max_valuedurée maximale du traitement

QuantityAndRate

AttributDescription
valuequantité d’unités détecté
unitunité normalisée (parmi une liste d’entités)
typeQUANTITY”, “DOSE” ou “STRENGTH”.
rateRate Lorsqu’une fraction est détectée, l’attribut rate est ajouté à l’attribut value avec les valeurs et unités des numérateur et dénominateur.

Rate

AttributDescription
numeratorquantité du numérateur
denominatorquantité du dénominateur
numerator_unitunité du numérateur
denominator_unitunité du dénominateur

Exemple d'ordonnance

Fichier original

Réponse structurée de l'API

full-bundle.json

{
  "fhirBundle": {
    "resourceType": "Bundle",
    "type": "transaction",
    "entry": [
      {
        "resource": {
          "resourceType": "Patient",
          "identifier": [
            {
              "system": "id://partner"
            }
          ]
        },
        "fullUrl": "urn:uuid:68ff0a08-89f5-408b-9d78-1106cba4c44d",
        "request": {
          "method": "POST",
          "url": "Patient"
        }
      },
      {
        "resource": {
          "resourceType": "Practitioner",
          "identifier": [
            {
              "system": "id://partner",
              "value": "partner-id"
            },
            {
              "system": "id://posos"
            }
          ]
        },
        "fullUrl": "urn:uuid:a3e2ce74-ff1f-443f-86b0-f9c53417749b",
        "request": {
          "method": "POST",
          "url": "Practitioner"
        }
      },
      {
        "resource": {
          "resourceType": "RequestGroup",
          "identifier": [
            {
              "system": "id://posos",
              "value": "145e8b78-8757-4b06-9fdc-a695b0d96add"
            }
          ],
          "text": {
            "status": "generated",
            "div": "<div xmlns=\"http://www.w3.org/1999/xhtml\"><ul><li>cellcept - 1 cp matin et soir pendant 15 jours</li><li>cortancyl - 60 mg par jour le matin au petit déjeuner pendant 3 semaines puis 50 mg/jour le matin pendant 3 semaines puis 40 mg/jour le matin pendant 3 semaines puis 30 mg/jour le matin pendant 3 semaines</li></ul></div>"
          },
          "authoredOn": "2023-01-31",
          "status": "draft",
          "intent": "order",
          "subject": {
            "reference": "urn:uuid:68ff0a08-89f5-408b-9d78-1106cba4c44d"
          },
          "author": {
            "reference": "urn:uuid:a3e2ce74-ff1f-443f-86b0-f9c53417749b"
          },
          "contained": [
            {
              "resourceType": "Medication",
              "id": "2af172dd-77e9-4f97-979f-c570c09abc57",
              "code": {
                "coding": [
                  {
                    "system": "http://posos.on.fhir/dci",
                    "code": "acide mycophénolique",
                    "display": "acide mycophénolique"
                  },
                  {
                    "system": "http://www.whocc.no/atc",
                    "code": "L04AA06",
                    "display": "MYCOPHENOLIQUE ACIDE"
                  },
                  {
                    "system": "http://posos.on.fhir/form",
                    "code": "comprimé pelliculé",
                    "display": "comprimé pelliculé"
                  }
                ]
              },
              "ingredient": [
                {
                  "itemCodeableConcept": {
                    "coding": [
                      {
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                {
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}